Школа юного агронома "Агродозор"
Министерство науки и высшего образования
Десятилетие
Президент России
Правительство
Российская академия наук
Министерство сельского хозяйства
Коллекция имеет статус государственного депозитария и является единственным в России в соответствии с Постановлением Правительства РФ координирующим центром по сбору, депонированию и хранению фитопатогенных микроорганизмов, непатогенных для человека и сельскохозяйственных животных, и используемых в агропромышленном комплексе РФ (защите растений, растениеводстве, селекции, биотехнологии, научных исследованиях и т.д.).
В настоящее время Государственная коллекция насчитывает более 5000 единиц хранения патогенных для растений штаммов, изолятов и образцов возбудителей наиболее вредоносных болезней относящихся к грибам, бактериям, вирусам, вироидам, фитоплазмам и нематодам, поражающим основные сельскохозяйственные культуры России: пшеницу, рожь, овес, ячмень, рис, картофель, овощи, некоторые технические культуры.
В работу Государственной коллекции внедрена система электронного учета приема, движения и выдачи коллекционных единиц хранения с использованием компьютерной Системы контроля патогенных материалов (PACS), которая обеспечивает возможность отслеживать весь путь движения каждого штамма от его поступления в Государственную коллекцию до отправки заказчикам или выбраковки при потере им биологических свойств. На каждый хранящийся фитопатогенный штамм Коллекции заведена компьютерная информационная карта (паспорт) с указанием различных свойств штамма.
Задачи Государственной Коллекции:
- Формирование, пополнение и централизованное гарантийное хранение актива коллекционных штаммов микроорганизмов, возбудителей наиболее опасных болезней экономически важных сельскохозяйственных культур, поддержание в жизнеспособном и биологически чистом состоянии всех штаммов, взятых на учет, сортов и линий растений-идентификаторов (дифференциаторов) патогенных штаммов.
- Обеспечение проведения фитопатологических, генетических, иммунологических, токсикологических и других, в том числе фундаментальных исследований, с целью разработки современных методов мониторинга эпидемий и их контроля.
- Составление каталогов коллекционных образцов фитопатогенных микроорганизмов с характеристикой их диагностических признаков, патогенных и вирулентных свойств и других показателей, указанных в информационной карте (паспорте) коллекционного образца.
- Пополнение коллекции новыми стабильными по всем признакам видами и штаммами фитопатогенных микроорганизмов, выделенными из образцов пораженных растений, доставленных из различных зон РФ природных или производственных экосистем, поступивших из рабочих коллекций отделов, лабораторий и групп института, а также полученных по обмену из российских и зарубежных коллекций.
- Совершенствование методов выделения, идентификации, размножения, хранения и генотипирования фитопатогенных микроорганизмов.
- Наработка патотипов и обеспечение биоматериалом селекционных центров, научно-исследовательских учреждений и других потребителей по их заявкам для проведения фитопатологических, генетических, иммунологических, токсикологических и других, в том числе фундаментальных исследований с целью разработки современных методов мониторинга эпидемий и их контроля.
- Учет, в том числе и компьютерный, поступления коллекционных образцов фитопатогенных культур, их движения в институте, рассылка заказчикам и выбраковка штаммов, потерявших жизнеспособность или патогенные свойства.
- Консервация и централизованное хранение генетически разнообразных штаммов фитопатогенных микроорганизмов.
- Обеспечение надежной физической защитой и системой биобезопасности хранящихся штаммов и другого биоматериала.
Коллекция используется для решения следующих вопросов фундаментальных и прикладных исследований:
- изучение изменений во времени и пространстве структур популяций в разных регионах России с целью прогноза опасных фитосанитарных ситуаций;
- мониторинг появления новых вирулентных патотипов; определение регионов их происхождения;
- изучение систем взаимодействия хозяин-патоген, полиморфизма видов, внутроивидовых таксонов и популяций с использованием молекулярно-генетических и биохимических методов (ПЦР, РАПД – анализ, ИФА и др.);
- изучение структур ДНК, структур и функций отдельных генов, а также участков генов для решения задач таксономии, систематики, идентификации, фитосанитарных прогнозов;
- тестирование генов устойчивости в исходном селекционном материале с использованием маркерных коллекций для оптимизации селекции на иммунитет;
- мониторинг динамики резистентности популяций и отдельных патотипов к препаратам из различных химических классов с целью своевременного внесения изменений в стратегию защиты от болезней;
- прогноз длительности сохранения устойчивости районированных и предлагаемых к районированию сортов на основе контроля динамики вирулентных рас и патотипов;
- обоснование состава искусственных инфекционных фонов для разных регионов с использованием генетического разнообразия коллекционных штаммов.
Сотрудники
| Коломиец Тамара Михайловна | заведующий коллекцией, ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук |
| Александрова Алина Витальевна | ведущий научный сотрудник, доктор биологических наук |
| Жемчужина Наталья Сергеевна | старший научный сотрудник, кандидат биологических наук |
| Елизарова Светлана Александровна | микробиолог |
| Скатенок Олег Олегович | технолог |
| Фокина Валентина Гавриловна | технолог |
| Паленкова Наталья Васильевна | технолог |
| Майорова Надежда Васильевна | старший лаборант-исследователь |
| Жемчужин Иван Александрович | техник |
Список публикаций
- Kovalenko E., Zhemchuzhina N., Kolomiets T., Kiseleva M., Pankratova L. Creation of the State Collection of Fusarium fungal strains. Abstract book of 12th European Fusarium Seminar, France, Bordeaux, May, 12-16, 2013, 166.
- Zhemchuzhina N., Ignatov A., Starygin V., Dubovoy V., Makarov A. Molecular Identification of Fusarium species pathogenic on cereals in Russia. Book of abstracts of ISM-MycoRed International Conference Europe 2013, Italy, Martina Franca, 27-31 May, 2013, 310.
- Жемчужина Н.С., Киселева М.И., Абрамова С.Л., Макаров А.А. Новые поступления в Государственную коллекцию фитопатогенных микроорганизмов Всероссийского ВНИИ фитопатологии. Штаммы Fusarium spp. Защита и карантин растений. – 2014. - №1. С. 48-50.
- Киселева М.И., Жемчужина Н.С., Коваленко Е.Д., Дубовой В.П., Макаров А.А. Новые поступления в Государственную коллекцию фитопатогенных микроорганизмов Всероссийского ВНИИ фитопатологии. Штаммы Bipolaris sorokiniana. Защита и карантин растений. – 2014. - №1. С. 50-52.
- Kolmer J. A., Kabdulova M. G., Mustafina M. A., Zhemchuzhina N. S. and Dubovoy V. Russian populations of Puccinia triticina in distant regions are not differentiated for virulence and molecular genotype. Plant Pathology, аrticle first published online: 30 JUN 2014, DOI: 10.1111/ppa.12248.
- Жемчужина Н.С., Жемчужина А.И., Киселева М.И., Дубовой В.П. Хранение уредоспор Puccinia triticina Eriks. в условиях криоконсервации // Современная микология в России. Третий Международный Микологический Форум. Москва. - 2015, - том 4. - С. 125.
- Дубовой В., Жемчужина Н., Елизарова С., Горелов П. Государственная коллекция фитопатогенных микроорганизмов ВНИИФ // Аналитика. - 2016. - № 1. - С. 76-78.
- Жемчужина Н.С., Киселева М.И., Елизарова С.А., Дубовой В.П. Влияние способов хранения на жизнеспособность и патогенность штаммов Alternaria alternata Государственной коллекции фитопатогенных микроорганизмов ФГБНУ ВНИИФ / Современная микология в России // Материалы четвертого съезда микологов России. 2017. Москва, Национальная академия биологии – Том 6 – С. 177-180.
- Жемчужина Н.С., Киселева М.И., Елизарова С.А. Жизнеспособность и патогенность штаммов грибов рода Fusarium Государственной коллекции фитопатогенных микроорганизмов ФГБНУ ВНИИФ после длительного хранения в условиях низких температур/ Материалы Международной научной конференции «Эпидемии болезней растений: мониторинг, прогноз, контроль». Большие Вязёмы Московской обл. 13-17 ноября 2017 г., стр. 328-335.
- Коломиец Т.М., Жемчужина Н.С., Панкратова Л.Ф., Александрова А.В., Киселева М.И., Елизарова С.А. Микромицеты Государственной коллекции фитопатогенных микроорганизмов, вызывающие микозы и микотоксикозы человека и животных. Успехи медицинской микологии. 2018. Т. 19. С. 371-372.
- Zhemchuzhina N.S., Kiseleva M.I., Zhemchuzhina A. I., Kolomiets T. M., Glinushkin A. P. Practical use of Puccinia triticina Eriks. isolates from the State Collection of Phytopathogenic Microorganisms of the All-Russian Research Institute of Phytopathology (ARRIP). Full Proceeding Book of International Agricultural, Biological and Life Science Conference, Edirne, Turkey, September 2-6, 2018, p. 393-398.
- Kolomiets T., Zhemchuzhina N. Genetic resources of the State Collection of Phytopathogenic Microorganisms of the All-Russian Research Institute of Phytopathology (ARRIP). Conference proceedings of XXXVII Annual Meeting of the European Culture Collection Organisation, Moscow, 13-15 September 2018, p. 45-46.
- Жемчужина Н.С., Елизарова С.А. Использование штаммов государственной коллекции фитопатогенных микроорганизмов ФГБНУ ВНИИФ в фитопатологических, селекционных и генетических исследованиях. сборник трудов международной научно-практической конференции «Наука, производство, бизнес: современное состояние и пути инновационного развития аграрного сектора на примере Агрохолдинга «Байсерке-Агро» посвященной 70-летию заслуженного деятеля Республики Казахстан Досмухамбетова Темирхана Мынайдаровича. 4-5 апреля 2019 г. Том 1, стр. 64-68.
- Жемчужина Н.С., Киселева М.И., Жемчужина А.И., Елизарова С.А. Жизнеспособность и вирулентность изолятов возбудителя бурой ржавчины пшеницы (Puccinia triticina Eriks.) при долгосрочном хранении. Сельскохозяйственная биология. 2019. Т. 54. № 3. С. 597-606.
- Жемчужина Н.С., Киселева М.И., Александрова А.В., Коломиец Т.М. Микромицеты на озимой пшенице в Краснодарском крае и Ростовской области // Защита и карантин растений. – 2020. – 6. – С.22-26.